Le département de l’Yonne abrite un aéroport desservant les villes d’Auxerre et Branches, connu sous le code AITA : AUF et code OACI : LFLA. Utilisé à maintes reprises par les joueurs de l’AJ Auxerre, il est ouvert aux IFR, aux VFR, aux avions privés et au trafic national commercial. En 2010, il a pu accueillir 12145 mouvements et 3069 passagers.
Situé à 7 km au nord-ouest d’Auxerre et à 4 km du sud-est de Branches, l’aéroport d’Auxerre-Branches, est géré par la CCI Yonne dont la base est localisée à Appoigny.
Côté infrastructures, il possède un parking de 200 places, d’une emprise au sol de 100 ha, d’une piste bitumée de 1650 m x 30 m avec une orientation 01/19 et balisage lumineux BI-PAPI-Feux à éclats. Sur place, la restauration est assurée par Le Relais des Ailes, la maintenance et la réparation des avions par Bayo et la fourniture de carburants par JET A1 AVGAS.